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高通量實驗室設計依據,設計標準

  • Jason Peng

  • Product Manager for 高通量實驗室設計依據,設計標準,Engaged in related product development for 15 years,with a wealth of related technical experience

  • 2023-02-25  |  Visits:


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高通量實驗室設計規范

NGS實驗室又叫高通量測序檢測實驗室。NGS是下一代測序技術即高通量測序技術的簡稱。高通量測序技術是對傳統Sanger測序(稱為一代測序技術)革命性的改變, 可同時對幾十萬到幾百萬條核酸分子進行序列測定,同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能, 也稱為深度測序。
NGS實驗室臨床應用的基本條件
1.1必須擁有符合臨檢中心相關規定的標準NGS實驗室。
1.2檢測設備必須符合標準NGS實驗室設置要求:高通量測序儀及配套服務器;高通量測序檢測試劑盒;通用電腦;自動分析軟件,實驗室樣本信息管理系統等。
1.3檢測人員必須通過專門的技能培訓,并獲得省級以上衛生計生行政部門頒發的臨床基因擴增檢驗技術上崗證書。NGS實驗室必須建立嚴格的實驗室管理制度、建立標準化操作程序(SOP)、建立系列質量管理文件等,確保實驗室日常運行符合國家衛生部的要求,確保檢測結果準確、確保實驗室衛生安全,確保實驗室長期穩定運行。
1.4NGS臨床應用必須在無菌無塵環境下進行操作。
NGS實驗室建設基本要求
2.1主體結構主體為彩鋼板、鋁合金型材。室內所有陰角、陽角均采用鋁合金50內圓角鋁,從而解決容易污染、積塵、不易清掃等問題。
2.2標準的各區分隔和氣壓調節將檢測過程分成試劑準備、樣本制備、PCR擴增和高通量測序四個獨立的實驗區。整個區域有一個整體緩沖走廊。每個獨立實驗區設置有緩沖區,同時各區通過氣壓調節,使整個檢測實驗過程中試劑和標本免受氣溶膠的污染并降低擴增產物對人員和環境的污染。可打開緩沖區和 PCR 擴增區的排風扇往外排氣,在實驗區的外墻上和各扇門上都安裝有風量可調的回風口,空氣通過回風口向室內換氣。
2.3消毒在每個實驗區和緩沖區頂部以及傳送窗內部安裝有紫外燈,供消毒用。在各區還設置移動紫外線燈,對實驗桌進行局部消毒。
2.4機械連鎖不銹鋼傳遞窗試劑和標本通過機械連鎖不銹鋼(不建議使用電子連鎖方式)傳遞窗傳遞,保證試劑和標本在傳遞過程中不受污染(人物分流)。
2.5地面地面建議使用PVC卷材地面或自流坪地面,整體性好。便于進行清掃,耐腐蝕。沒有條件的也可采用水磨石地面,或大塊的瓷磚(至少800mm×800mm)接縫需要小于2mm。
2.6照明燈具要選用凈化燈具,能達到便于清洗、不積塵的特點。
2.7平面布局NGS實驗室應根據自己的檢驗項目、所采用的檢測技術平臺和工作量來決定分區的多少及各區域的空間大小,至少具體需要多少個區,同樣是“個體化”的,以“工作有序、互不干擾、防止污染、報告及時”作為基本原則。
各項目實驗室建設標準
產前篩查與產前診斷(全基因組低拷貝測序技術)
1.實驗室平面圖
▲圖1:產前篩查與診斷實驗室平面圖
2. 技術流程圖
▲圖2:產前篩查與診斷技術流程圖
3. 技術參數分區
壓力 溫度 相對 濕度照明專用
走廊0Pa
緩沖區+5Pa
試劑準備室+15Pa 20-25℃ 40%~60% 主實驗室≥300LX,其余房間200~300LX
標本與文庫制備區 +10Pa
文庫擴增與檢測區 -5Pa
測序區 -10Pa
4.分區功能
4.1試劑準備室
主要功能:在NGS過程中使用到的試劑的配制、分裝和保存。
4.2標本與文庫制備區
主要功能:血液處理、血漿制備、DNA提取、DNA片段化、DNA樣品的純化、DNA濃度檢測、末端修復、接頭連接、構建樣本的測序文庫。
4.3文庫擴增與檢測區
主要功能:文庫構建后的PCR擴增與純化、文庫濃度檢測、文庫的混合及混合后的質檢分析。
4.4測序區
主要功能:測序模板制備(乳液PCR與磁珠富集回收)、上機測序、數據分析、報告審核及發放。
5.儀器配置
5.1試劑準備室
主要儀器設備:加樣器、冰箱、分析天平、微量臺式離心機、渦旋振蕩器、移液器、可移動紫外燈和超凈工作臺等。
5.2標本與文庫制備區
主要儀器設備:冷凍離心機、微量臺式離心機、掌上三管離心機、渦旋震蕩器、垂直混合儀、移液器、可移動紫外燈、生物安全柜、冰箱、托盤天平、Qubit 2.0核酸定量儀、電腦(可連接互聯網)、條形碼打印機、普通打印機、掃描槍、磁力架等。
5.3文庫擴增與檢測區
主要儀器設備:PCR儀、QPCR儀、Qubit2.0核酸定量儀、可移動紫外燈、超凈工作臺、冰箱、微量臺式離心機、渦旋振蕩器、UPS、冰箱、移液器、磁力架等。
5.4測序區
主要儀器設備:高通量測序儀、PC電腦、打印機、UPS、恒溫金屬浴、純水儀、冰箱、微量臺式離心機、渦旋振蕩器、移液器、超凈工作臺、可移動紫外燈、磁力架、PCR儀等。
n胚胎植入前遺傳學診斷(全基因組低拷貝測序)
1. 實驗室平面圖
▲圖3:PGD實驗室平面圖
▲圖4:PGD技術流程圖
3. 技術參數
分區 壓力 溫度 相對 濕度照明
專用走廊 0Pa
緩沖區 +5Pa
試劑準備室 +15PaWGA
制備室 +10pa 20-25℃ 40%~60% 主實驗室≥300LX,其余房間200~300LX
擴增一區 -5pa
標本檢測區 -10Pa
測序區 -15Pa
電泳區 0Pa
4. 分區功能
4.2WGA制備區
主要功能:基因組DNA釋放、全基因組DNA擴增。
4.3電泳區
主要功能: DNA電泳檢測及結果反饋、DNA打斷等
4.4擴增一區
主要功能:DNA片段的末端修復與純化、接頭連接與純化、文庫混合、缺口平移。
4.5文庫檢測區
主要功能:文庫濃度質檢分析。
4.6測序區
5.1試劑準備區
主要儀器設備:冰箱、分析天平、微量臺式離心機、渦旋振蕩器、移液器、可移動紫外燈和超凈工作臺等。
5.2電泳區
主要儀器設備:電泳儀、微波爐、凝膠成像儀、冰箱、掌式離心機、渦旋振蕩器、移液器、可移動紫外燈等。
5.3WGA制備區
主要儀器設備:PCR儀、超凈工作臺、冰箱、掌式離心機、渦旋振蕩器、移液器、可移動紫外燈等。
5.4擴增一區
主要儀器設備:PCR儀、可移動紫外燈、超凈工作臺、冰箱、微量臺式離心機、渦旋振蕩器、UPS、移液器、磁力架等。
5.5文庫檢測區
主要儀器設備: QPCR儀、Qubit2.0核酸定量儀、可移動紫外燈、超凈工作臺、冰箱、微量臺式離心機、渦旋振蕩器、冰箱、移液器等。
5.6測序區
n遺傳病診斷+腫瘤診斷與治療(雜交捕獲測序技術+Sanger測序驗證)
▲圖5:腫瘤診斷實驗室平面圖
▲圖6:腫瘤診斷技術流程圖
▲圖7:一代測序實驗流程圖
分區 壓力 溫度 相對濕度 照明
潔凈走廊 0Pa
試劑準備室 +15Pa
DNA打斷區 +10Pa 20-25℃ 40%~60% 主實驗室≥300LX,其余房間200~300LX
雜交捕獲區(擴增一區) -5Pa
文庫擴增區(擴增二區) -10Pa
文庫檢測區 -10Pa
電泳區 0 Pa
4.1試劑準備區
主要功能:樣本接收、樣本前處理、全基因組DNA提取以及各種樣本DNA或者RNA的提取、DNA片段化、DNA純化、DNA濃度測定、DNA片段的末端修復與純化、接頭連接與純化。
4.3DNA打斷區
主要功能: DNA打斷(片段化)。
4.4電泳區
主要功能:片段化DNA電泳檢測及結果反饋。
4.5雜交捕獲區(擴增一區)
主要功能:目的DNA片段的雜交捕獲與純化,Sanger測序目的片段擴增與純化、Sanger測序PCR前準備。
4.6文庫擴增區(擴增二區)
主要功能:雜交捕獲后擴增與純化、文庫濃度質檢分析、及Sanger測序的PCR擴增反應與純化。
4.7測序區
主要功能:測序模板制備(乳液PCR與磁珠富集回收)、上機測序、及Sanger測序。
主要儀器設備:微量臺式離心機、掌上三管離心機、恒溫金屬浴、移液器、可移動紫外燈、生物安全柜、冰箱、托盤天平、Qubit 2.0核酸定量儀、PCR儀、電腦(可連接互聯網)、條形碼打印機、普通打印機、掃描槍等。
5.3DNA打斷區
主要儀器設備:Covaris S220超聲波打斷儀、冰箱、掌式離心機、渦旋振蕩器、移液器、可移動紫外燈等。
5.4電泳區
5.5雜交捕獲區(擴增一區)
主要儀器設備:PCR儀、可移動紫外燈、超凈工作臺、冰箱、微量臺式離心機、渦旋振蕩器等。
5.6文庫擴增區(擴增二區)
主要儀器設備:PCR儀、Qubit 2.0核酸定量儀、微量臺式離心機、掌上三管離心機、渦旋震蕩器、移液器、可移動紫外燈、超凈工作臺、冰箱、磁力架等。
5.7測序區
主要儀器設備:高通量測序儀、Sanger測序儀、PC電腦、打印機、UPS、恒溫金屬浴、純水儀、冰箱、微量臺式離心機、渦旋振蕩器、移液器、超凈工作臺、可移動紫外燈、磁力架、PCR儀等。

實驗室設計效果圖 實驗室設計效果圖
   

細胞實驗室設計建設標準

什么叫細胞實驗室?
細胞實驗室是進行細胞操作的實驗室,通常會做細胞操作、細胞培養、細胞分離、細胞檢測等。細胞培養是一種無菌操作技術,要求工作環境和條件必須保證無微生物污染和不受其它有害因素的影響。細胞培養室和設計原則是防止微生物污染和有害因素影響,要求工作環境清潔,空氣清新,干燥和無煙塵。
細胞實驗室的建設標準
目前在細胞實驗的實驗室階段,國家目前還沒有相應的標準,在利用細胞治療以及細胞藥物這塊,國家有一些初步的標準,并且有些地方有自己的地方標準。具體如下:
《細胞庫質量管理規范》
《臨床細胞治療技術平臺設置基本要求》DB31/T687-2013
《臨床組織工程技術平臺基本要求》DB31/T979-2016
《干細胞制劑制備質量管理自律規范》
《細胞制備中心建設與管理規范》SZDBZ 188-2016
《干細胞臨床研究管理辦法(試行)》
以上的規范主要是針對細胞的臨床治療的具體規定,隨著細胞治療應用的越來越普遍,相信國家也會出臺正式的國家標準,目前的臨床主要是按照臨床的標準,細胞制劑主要是按照藥物生產的標準,也就是GMP的標準。
細胞實驗室裝修的設計參數
細胞實驗室裝修的設計參數分為2部分,即:室外設計參數、室內設計參數。詳細參數如下:
室外設計參數:夏季室外空調計算干球溫度30.6℃,濕球溫度24.5℃;冬季室外空調計算干球溫度-25℃,相對濕度68%。
室內設計參數:萬級潔凈區室內設計溫度為20~24℃,相對濕度為45%~60%;10萬級潔凈區室內設計溫度為18~26℃,相對濕度為45%~65%。

實驗室設計效果圖 實驗室設計效果圖
   

實驗室設計裝修關鍵點有哪些

關于實驗室裝修設計,無論是新建、擴建或是改建項目,都需要極大的工程量。它不單純是選購合理的儀器設備,還要綜合考慮實驗室的總體規劃、合理布局和平面設計,以及供電、供水、供氣、通風、空氣凈化、安全措施、環境保護等基礎設施和基本條件。/a,無論是新建、擴建或是改建項目,都需要極大的工程量。它不單純是選購合理的儀器設備,還要綜合考慮實驗室的總體規劃、合理布局和平面設計,以及供電、供水、供氣、通風、空氣凈化、安全措施、環境保護等基礎設施和基本條件。
1.平面布局設計
實驗室平面布局設計是根據實驗室性質、實驗室的目標定位、實驗室的功能要求、實驗類型以及實驗工藝流程等因素,按照國家相關標準針對實驗室既有場地進行科學、合理的功能間區分和布局的工作。
2.實驗室通風設計規范
實驗室通風系統設計是實驗室設計中的重要關鍵點,也是實驗室建設成敗的關鍵因素。實驗室通風系統設計包含排風系統和補風系統兩方面。
實驗室通風系統的設計應根據《采暖通風與空氣調節設計規范》,《民用建筑供暖通風空氣調節設計規范》等規范,排風系統則需要通過實際實驗室所需排風風量、管道長度、管道走向以及現場實際情況,依據流體力學進行綜合的分析計算,科學合理的設計排風系統,進而達到設計上實驗室的安全、舒適、節能等目的。
實驗室中的電器工程設計
3.中的電器工程設計
實驗室電氣工程設計包含強弱電兩方面。強電方面主要包含儀器用電、照明插座等,弱電包含:網絡、數據通信、廣播、視頻監控等等。
4.是按時排水設計
實驗室給排水包含自來水和純水。因為實驗室的給排水好的方式都是采用暗裝,所以設計如果有遺漏的話將會給后期的實驗室管理帶來很大的不便和煩惱。
普通自來水一般而言,實驗室給水管道選用優質的管道,主管可以選用,支管可以選用;排水管選用優質的管道,一般選擇或,特殊情況可以選用的。
5.實驗室空調系統
實驗室的溫濕度應根據實驗要求設計,普通的理化室采用普通的分體空調或多聯機即可。對于精密儀器室對溫濕度有一定的要求,比如等。另有一些特殊的如纖維檢驗、紙品檢測、紡織面料等對溫濕度都有更高的要求。
實驗室照度及噪音控制設計
根據生物安全實驗室建筑技術規范要求實驗室照度不低于,噪聲不超過。實驗室內裝修前,向施工方提出了實驗室的照度要求,建成后又進行了照度檢測,機房照度約為,核心工作區照度約為,基本符合實驗室建設標準。采取水電獨立等措施后實驗室環境噪音明顯減小,尤其是在相對獨立的核心工作區測定分貝數與普通診室基本相同。
實驗室凈化及凈化等級
實驗室建設前應根據微生物和生物醫學實驗室生物安全通用準則、實驗室生物安全通用要求、病原微生物實驗室生物安全管理條例(國務院號令)進行生物安全評估,確定實驗室是否需要凈化以及凈化等級。
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實驗室設計效果圖 實驗室設計效果圖
   

實驗室設計不專業會帶來很多麻煩

新建實驗室時首先是要進行實驗室設計
,但是實驗室設計不專業的話將會帶來很多麻煩。實建家下面將會告訴您,如果實驗室設計不專業的話將會帶來哪些麻煩?
實驗室設計不專業的話將會帶來以下的麻煩:
1、實驗室建成后,無法滿足甲方的實際需要。例如:實驗室建成后,發現設計中沒有考慮到很多問題,包括無法安裝儀器,沒有水源或電源,或者接口不在設備附近,地面容易被腐蝕花,工作流程不暢,通風不夠,空間不夠,沒有防震設備,溫濕度記錄與控制不能正常運行,裝飾材料不符合需求等。
實驗室設計
2、實驗室的維護和維修無法正常進行。實驗室建成進入試運行時,可能發現很多問題,但是得不到及時糾正,施工單位往往提出這是設計的問題,責任不清。所以,不要采用免費的設計方案,必須找有相關設計經驗的公司進行專業設計,簽訂設計合同,支付合理設計費,避免貪圖免費設計而導致后面不合理的工程施工損失更大。
3、實驗室設計無法滿足進一步發展的需要。按設計圖紙施工后,所得到的實驗室無法進一步發展,如沒有空間安放新的儀器設備,沒有安裝好電腦接口,使設備無法滿足信息化建設的要求。
4、實驗室設計不符合消防要求。有些實驗室建設過程中沒有經過消防審查。
5、實驗室施工實驗室裝修中為常見的問題。如中標480萬,結算時卻需要600萬。還有就是實驗室存在職業危害隱患。

實驗室設計效果圖 實驗室設計效果圖
   

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